Sesuai dengan Rencana Strategis Universitas Mulawarman, pengembangan pendidikan program studi keteknikan adalah merintis pendidikan program ilmu teknik pada jenjang studi strata 1 (S1). Pada tahun 2004 dikeluarkan Ketetapan Dirjen Dikti Depdiknas Nomor 2051/D/T/2004 tentang Ijin Penyelenggaraan Program Studi S1 Teknik Lingkungan.
Pada tahun 2019 Program Studi Teknik lingkungan berhasil memperoleh akreditasi dengan peringkat A berdasarkan Surat Keputusan BAN-PT Nomor 3508/SK/BAN-PT/Akred/S/IX/2019, yang berlaku hingga tahun 2024.
Pada tahun 2024, Program Studi Teknik Lingkungan pada Program Sarjana Universitas Mulawarman, Samarinda berhasil memperoleh akreditasi dengan peringkat UNGGUL berdasarkan Surat Keputusan LAM Teknik No. 0621/SK/LAM Teknik/AS/XII/2024. Sertifikat tersebut berlaku mulai tanggal 21 Desember 2024 hingga 20 Desember 2029.
